冷卻風扇轉子的不平衡會使風扇產生振動。當風扇轉子旋轉時，由于轉子的物理質心和轉軸慣性中心不在同一軸上，轉子就會不平衡。轉子物理質心與軸承慣性中心之間的最近距離稱為偏心距離。當轉子旋轉時，由于離心力的作用，轉軸支架產生振動，振動通過基礎路徑傳遞到機械的各個部分。

其離心力公式為：F=mrω2=Meω2

其中F：離心力m：不平衡質量r：質量不平衡與轉軸中心之間的距離ω：轉子轉速M：轉子總重量e：轉子偏心距

風扇的振動應控制不平衡的質量，并制定平衡等級標準。振動不僅降低了風扇的使用壽命，而且增加了風扇運行的噪音或異常噪音。負責任的制造商的風扇熱器產品在出廠前檢測振動，并用微機平衡機校正超過平衡等級的人。